一、本罪与非罪的界限
其关键要查清行为人是否有主观罪过，是否实施了违反交通运输管理法规的行为，违反交通运输管理法规的行为与重大交通事故是否具有因果关系等。如果没有违法行为或者有违法行为但没有因果关系，如果事故纯属被害人不遵守交通规则，乱过马路，或者是山崩、地裂、风暴、洪水等自然因素造成的，则不应以此罪论处。
当然，事故发生不排除可能存在多种原因或其他干预因素。在这里，我们应该仔细分析原因及其干预行为对交通事故的影响。只有查明与行为人的违规行为确实有因果关系，才能以本罪论处，否则不应以本罪追究刑事责任。例如，行为人高速超车后突然发现前方几十米处有人穿越马路，便打方向盘试图避开行人，但出于车速过快，致使车冲入人行道而将他人压成重伤。此时，行人过马路作为干预因素，只是本案的条件。事故的真正原因是非法超速行驶。因此，应当认定行为与结果之间存在因果关系，可以构成本罪。
二、与其他罪名的界限
1.本罪与重大行事故罪、铁路运营安全事故罪的界限
本罪与重大飞行事故罪、铁路运营安全事故罪同属重大交通肇事的犯罪。客体均为交通运输安全，主观上也都出于过失，客观上也是都是以违反保障交通运输安全管理的规章制度并造成严重后果为要件。其区别主要是：
（1）主体不同。本罪的主体为一般主体；而后二罪，主体为特殊主体，即分别为航空人员与铁路职工，其他自然人一般主体不能构成这两种罪。
（3）违反的具体注意义务不同。根据运输领域不同（公路、水上），本罪行为人违反的可以是特定的注意义务，也可以使一般的注意义务；而后两罪违反的，只限于特定的注意义务。
2.交通肇事逃逸的认定
《最高人民法院关于审理交通肇事刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第三条 “交通运输肇事后逃逸”，是指行为人具有本解释第二条第一款规定和第二款第（一）至（五）项规定的情形之一，在发生交通事故后，为逃避法律追究而逃跑的行为。
也就是说，所谓“交通肇事逃逸”是指行为人在交通肇事中有下列情形，并因逃避法律追究而逃跑的行为：
（1）死亡一人或者重伤三人以上，负事故全部或者主要责任的；
（2）死亡三人以上，负事故同等责任的；
（3）造成公共财产或者他人财产直接损失，负事故全部或者主要责任，无能力赔偿数额在三十万元以上的；
（4）酒后、吸食毒品后驾驶机动车辆致一人以上重伤，负事故全部或者主要责任的；
（5）无驾驶资格驾驶机动车辆致一人以上重伤，负事故全部或者主要责任的；
（6）明知是安全装置不全或者安全机件失灵的机动车辆而驾驶致一人以上重伤，负事故全部或者主要责任的；
（7）明知是无牌证或者已报废的机动车辆而驾驶致一人以上重伤，负事故全部或者主要责任的；
（8）严重超载驾驶致一人以上重伤，负事故全部或者主要责任的。
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