公安机关对刑事案件进行立案后，案件是不会自动撤销的，只有经公安机关侦查后，没有犯罪现实或者犯罪情节轻微的，才会撤销案件。
二、法律规定
《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百八十三条经过侦查，发现具有下列情形之一的，应当撤销案件：
（一）没有犯罪事实的；
（二）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（三）犯罪已过追诉时效期限的；
（四）经特赦令免除刑罚的；
（五）犯罪嫌疑人死亡的；
（六）其他依法不追究刑事责任的。
对于经过侦查，发现有犯罪事实需要追究刑事责任，但不是被立案侦查的犯罪嫌疑人实施的，或者共同犯罪案件中部分犯罪嫌疑人不够刑事处罚的，应当对有关犯罪嫌疑人终止侦查，并对该案件继续侦查。
我们可以了解到根据规定公安机关对刑事案件进行立案后案件是不会自动撤销的，但是如果经过侦查发现没有犯罪事实可能会撤销案件。
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