不可以的，新农合解决的是因疾病引起的医药费用。新型农村合作医疗报销范围为：参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分(即有效医药费用)。
因交通事故住院新农合是不会报销的，只能是由肇事者负责任赔偿。因为依据相关规定，应当由第三人负担的医疗费用，不纳入基本医疗保险基金支付范围。如果符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照规定承担赔偿责任。
二、交通事故受伤的赔偿项目有什么
1、医疗费
在实务中包括实际支出的费用和后期治疗费。在诉讼中，实际发生的费用以一审辩论终结为截止时间，此前发生的数额为责任人赔偿的数额。此后发生的费用可以协商解决，大多是另案处理，等实际发生后，再行赔付。
2、误工费
误工时间根据受害人接受治疗的医疗机构出具的证明确定。受害人因伤致残持续误工的，误工时间可以计算至定残日前一天。受害人有固定收入的，误工费按照实际减少的收入计算。受害人无固定收入的，按照其最近三年的平均收入计算，受害人不能举证证明其最近三年的平均收入状况的，可以参照受诉法院所在地相同或者相近行业上一年度职工的平均工资计算。
3、住院伙食补助费
住院伙食补助费可以参照当地国家机构一般工作人员的出差伙食补助标准予以确定。受害人确有必要到外地治疗，因客观原因不能住院，受害人本人及其陪护人员实际发生的住宿费和伙食费，其合理部分应予赔偿。
合作医疗保险不能报销，不符合法律要求，因车祸受伤的要由肇事司机承担赔偿责任，要给医疗费，误工费，营养费，医疗费包括两个方面，一个是实际支出的费用，另一个是后续治疗费用，会根据医院的收款凭证进行确认，误工费要按受害者误工的时间，受害者的工资进行计算。
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