南水北调工程是属于公益性的项目，南水北调工程的管道经过村民所在土地的，土地一般是征收而不是租用，征收是给予一次性的经济补偿。《土地管理法》第四十五条为了公共利益的需要，有下列情形之一，确需征收农民集体所有的土地的，可以依法实施征收：
（一）军事和外交需要用地的；
（二）由政府组织实施的能源、交通、水利、通信、邮政等基础设施建设需要用地的；
（三）由政府组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、生态环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社区综合服务、社会福利、市政公用、优抚安置、英烈保护等公共事业需要用地的；
（四）由政府组织实施的扶贫搬迁、保障性安居工程建设需要用地的；
（五）在土地利用总体规划确定的城镇建设用地范围内，经省级以上人民政府批准由县级以上地方人民政府组织实施的成片开发建设需要用地的；
（六）法律规定为公共利益需要可以征收农民集体所有的土地的其他情形。前款规定的建设活动，应当符合国民经济和社会发展规划、土地利用总体规划、城乡规划和专项规划；
第（四）项、第（五）项规定的建设活动，还应当纳入国民经济和社会发展年度计划；
第（五）项规定的成片开发并应当符合国务院自然资源主管部门规定的标准。
二、土地征用和租用有什么区别
土地征用和租用的最主要区别：
征用具有行政强制性，而租用是双方在平等自愿的基础上建立的。
1、土地征用是指国家为了社会公共利益的需要，依据法律规定的程序和批准权限批准，并依法给予农村集体经济组织及农民补偿后，将农民集体所有土地使用权收归国有的行政行为。
国家行政机关有权依法征用公民、法人或者其他组织的财物、土地等。
2、国有土地租用是指国家将国有土地出租给使用者使用，由使用者与县级以上人民政府土地行政主管部门签订一定年期的土地租赁合同，并支付租金的行为。
国有土地租赁是国有土地有偿使用的一种形式，是出让方式的补充。
土地租赁合同经出租方同意后可以转让，改变原合同规定的使用条件，应当重新签订土地租赁合同。
租赁土地上的房屋等建筑物、构筑物可以依法抵押，抵押实现时，土地租赁合同同时转让。
法律对南水北调工程铺设管道上的土地是征收还是租用没有明确的规定。
但一般情况下，南水北调项目属于国家重大公益项目，使用的土地，一般是按征收给予经济补偿，而不是按租用来进行处理的。
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