公司清算注销后，发现有未收回款的，按以下方式处理：
第一，对于公司已注销后发现公司的遗漏财产，如在诉讼时效之内的，各债权人的债权未能满足的，该财产首先应当按比例分配给公司的债权人；
第二，如果各个债权人的债权已经得到满足的，则公司该财产归属于股东所有，应当按照协议约定分配给各个股东；
第三，如已超过诉讼时效三年，则该财产归属于公司也就是由原股东按出资比例获得财产分配；
第四，如果该公司已消亡且股东也已下落不明，无人主张该项权利的，公司遗漏的财产应当收归国家所有；
第五，对于仅仅发现财产线索尚未取回的，只要无人主张权利，法院也无须按照权利进行追索。
二、法律规定
《中华人民共和国公司法》第一百八十六条清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。
公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。
公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。
第一百八十七条清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。
公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。
按照规定公司清算注销后如果发现有未收回款的可以将它分配给公司的债权人，按照股东出资比例进行分配，制定一个清算方案，按照方案执行就可以了。
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