大股东被人民法院起诉后，不影响法人代表变更，公司作出法人代表变更决议后，公司可以变更法人代表。《中华人民共和国公司法》第十三条【法定代表人】公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。《中华人民共和国公司登记管理条例》第三十条公司变更法定代表人的，应当自变更决议或者决定作出之日起30日内申请变更登记。
二、公司法人变更所需材料
1、法定代表人签署的《企业法人变更登记申请书》(企业加盖公章)；
2、《指定代表或者共同委托代理人的证明》(企业加盖公章)及指定代表或委托代理人的身份证复印件(本人签字)；
应标明具体委托事项、被委托人的权限、委托期限。
3、《公司(企业)法定代表人登记表》(本人签字，企业加盖公章)；
4、主管部门(出资人)根据企业章程的规定和程序出具的原任法定代表人的免职证明、新任法定代表人的任职证明；
任职证明应依照企业章程的规定明确任命职务；
章程规定职务空缺、以副职代理法定代表人的，应在其任职证明中明确“章程规定职务空缺，由副职代理法定代表人”。
5、法律、行政法规和国务院决定规定变更法定代表人必须报经批准的，提交有关的批准文件或者许可证书复印件；
6、《企业法人营业执照》副本。
注：
依照《企业法人登记管理条例》设立的企业法人申请法定代表人变更登记适用本规范。
通过上述分析知道，依据《公司登记管理条例》的规定，公司变更法定代表人的，应当自变更决议或者决定作出之日起30日内申请变更登记。
所以公司大股东被法院起诉的，公司作出变更法人代表的决议后，不影响法人代表变更登记。
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